• wykorzystanie środowiska gridowego, jako jednolitej architektury dostępu do danych oraz zasobów, jak również do dynamicznego tworzenia wirtualnych organizacji badaczy i lekarzy pracujących nad pojedynczym, bądź wieloma jednocześnie przypadkami danej choroby nowotworowej;

• wprowadzenie i stosowanie międzynarodowych standardów biomedycznych i informatycznych. Do standardów biomedycznych zaliczyć tutaj należy HL7 (szczególnie nowy model genotypu kliniczno-genetycznego), Electronic Health Record, PML (Polymorphism Markup Language), standardy reprezentacji wiedzy i różnorodne protokoły (GLIF: guideline interchange format).

ACGT jest projektem fundowanym przez Komisję Europejską, którego celem jest dostarczenie nowej broni do walki z rakiem. Realizacja tego zadania polega na stworzeniu narzędzi umożliwiających dokładniejszą identyfikacje choroby oraz wspomaganie lekarza w procesie leczenia pacjenta. W projekcie zamierza się wykorzystać możliwości jakie daje zaawansowane środowisko gridowe do analizy i porównywania danych klinicznych i genetycznych z rezultatami badań zgromadzonymi w bazach danych. Ma to na celu szybkie diagnozowanie, a także definiowanie dokładnej terapii dla każdego pacjenta. PCSS odpowiedzialny jest ze dostarczenie podstawowej platformy gridowej dla projektu.

W wyniku prac w projekcie stworzono środowisko zapewniające naukowcom i lekarzom łatwy dostęp do różnorodnych aplikacji wspomagających proces diagnozy i leczenia oraz analizy wyników badań. Platforma ta umożliwia budowanie wirtualnych organizacji umożliwiających współprace różnych grup naukowców w jednym projekcie, aktywnie wspomagając współdzielenie danych oraz obliczeń. Zaimplementowana w projekcie infrastruktura, oprócz dostępu do zasobów obliczeniowych, oferuje również integracje wielu źródeł danych i możliwość rozproszonego dostępu do nich. Ważnym wynikiem prac w ACGT jest zaprojektowanie ontologii opisującej wiedzę dziedzinową z zakresu badań nad rakiem.

Zastosowanie technologii gridowej w projekcie ma istotne znaczenie. Z jednej strony dostarcza ona uniwersalnych mechanizmów współdzielenia rozproszonych zasobów przez różnorodne grupy naukowców z Europy i świata poprzez tworzenie wirtualnych organizacji. Z drugiej strony, zwiększa możliwości wykorzystania aplikacji intensywnych obliczeniowo co powoduje raptowny wzrost dokładności obliczeń, lub istotne zmniejszenie czasu oczekiwania na wyniki.

Pierwszy wspomniany powyżej aspekt, implementowany jest w projekcie ACGT w postaci zestawu usług wysokiego poziomu zorientowanego na specyficzne problemy biomedyczne. Chodzi tu głownie o dostarczenie środowiska dla naukowców i lekarzy umożliwiającego w prosty sposób skorzystanie z istniejących zasobów bazodanowych oraz prostych mechanizmów przetwarzania tych danych w postaci przepływu akcji (workflow), w którym dane wyjście jednego algorytmu są wejściem dla innego. Warstwa ta osadzona jest na uniwersalnej platformie gridowej zbudowanej w oparciu o szeroko stosowane technologie gridowe (Globus Toolkit) wspomagane przez zaawansowane mechanizmy wyższego poziomu odpowiedzialne za zarządzanie zasobami obliczeniowymi, zarządzanie danymi, czy też zapewniające uniwersalne mechanizmy autoryzacji (Gridge Toolkit).

W zakresie badań obliczeniowych, najbardziej istotna w ACGT jest aplikacja służąca do symulacji rozwoju guza rakowego (Oncosimulator), w zależności od zaaplikowanej formy leczenia - radioterapia, chemioterapia. Ponadto istotna role odgrywa tu profil genetyczny pacjenta i próby porównywania tego profilu z istniejącymi bazami danych opisującymi pacjenta i jego reakcje na rożne formy leczenia. Znalezienie takich zależności między szeroko pojętym profilem biochemicznym chorego a jego odpowiedzią na terapie to wielkie wyzwanie stojące przed środowiskami onkologicznymi. Tego typu aplikacja może stanowić dla lekarza nieocenione narzędzie do walki z nowotworami.

Podstawowe elementy funkcjonalne środowiska ACGT:

• aplikacje służące do odkrywania wiedzy i analizy danych;
• zaawansowana platforma dostępu do aplikacji z systemem budowania zadań typu 'workflow';
• system automatycznej rejestracji i udostępniania nowych usług;
• transparentny dostęp do zasobów obliczeniowych;
• integracja heterogenicznych źródeł danych z możliwością wykonywania rozproszonych zapytań;
• jednolita architektura bezpieczeństwa;
• możliwość współdzielenia danych oraz obliczeń;
• zaawansowany projekt ontologii dla wiedzy dziedzinowej związanej z badaniami nad rakiem;
• narzędzia wspomagające lekarzy w procesie dokumentowania przebiegu leczenia (clinical trials);
• narzędzia służące do anonimizacji i pseudonimizacji danych szpitalnych przed udostępnieniem ich do badań;
• zaawansowana analiza

Najważniejszym elementem innowacyjnym jest utworzenie prawdziwie multidyscyplinarnego modelu współpracy, otwartego nie tylko na badaczy w Europie, ale również w pozostałych regionach świata. Do tej pory brak odpowiednich metod oraz, co być może jest nawet ważniejsze, odpowiedniej, wspólnej i jednolitej infrastruktury uniemożliwiały szpitalom oraz klinikom udział w procesie analizy różnorodnych baz danych i źródeł wiedzy.